Lea el archivo desde la línea 2 u omita la fila del encabezado

f = open(fname,'r')
lines = f.readlines()[1:]
f.close()

Si desea la primera línea y luego desea realizar alguna operación en el archivo, este código será útil.

with open(filename , 'r') as f:
    first_line = f.readline()
    for line in f:
            # Perform some operations

f = open(fname).readlines()
firstLine = f.pop(0) #removes the first line
for line in f:
    ...

Si el corte podría funcionar en iteradores...

from itertools import islice
with open(fname) as f:
    for line in islice(f, 1, None):
        pass

 with open('old.csv', 'r') as f, open('new.csv', 'w') as ff:
    first_line = f.readline()
    for line in f:
        line = line.translate({ord(i):None for i in 'abcd'})
        ff.write(line)
    ff.seek(0)
    ff.write(first_line)

# Open a connection to the file
with open('world_dev_ind.csv') as file:

    # Skip the column names
    file.readline()

    # Initialize an empty dictionary: counts_dict
    counts_dict = {}

    # Process only the first 1000 rows
    for j in range(0, 1000):

        # Split the current line into a list: line
        line = file.readline().split(',')

        # Get the value for the first column: first_col
        first_col = line[0]

        # If the column value is in the dict, increment its value
        if first_col in counts_dict.keys():
            counts_dict[first_col] += 1

        # Else, add to the dict and set value to 1
        else:
            counts_dict[first_col] = 1

# Print the resulting dictionary
print(counts_dict)

Para generalizar la tarea de leer varias líneas de encabezado y mejorar la legibilidad, usaría extracción de métodos. Supongamos que desea tokenizar las tres primeras líneas de coordinates.txt para usar como información de encabezado.

Ejemplo

coordinates.txt
---------------
Name,Longitude,Latitude,Elevation, Comments
String, Decimal Deg., Decimal Deg., Meters, String
Euler's Town,7.58857,47.559537,0, "Blah"
Faneuil Hall,-71.054773,42.360217,0
Yellowstone National Park,-110.588455,44.427963,0

Entonces la extracción del método le permite especificar lo que desea hacer con la información del encabezado (en este ejemplo, simplemente tokenizamos las líneas del encabezado en función de la coma y las devolvemos como una lista, pero hay espacio para hacer mucho más).

def __readheader(filehandle, numberheaderlines=1):
    """Reads the specified number of lines and returns the comma-delimited 
    strings on each line as a list"""
    for _ in range(numberheaderlines):
        yield map(str.strip, filehandle.readline().strip().split(','))

with open('coordinates.txt', 'r') as rh:
    # Single header line
    #print next(__readheader(rh))

    # Multiple header lines
    for headerline in __readheader(rh, numberheaderlines=2):
        print headerline  # Or do other stuff with headerline tokens

Salida

['Name', 'Longitude', 'Latitude', 'Elevation', 'Comments']
['String', 'Decimal Deg.', 'Decimal Deg.', 'Meters', 'String']

Si coordinates.txt contiene otra línea de encabezado, simplemente cambie numberheaderlines. Lo mejor de todo es que está claro lo que __readheader(rh, numberheaderlines=2) está haciendo y evitamos la ambigüedad de tener que averiguar o comentar por qué el autor de la respuesta aceptada usa next() en su código.