Trazar dos histogramas al mismo tiempo con matplotlib

Las respuestas aceptadas dan el código para un histograma con barras superpuestas, pero en caso de que desee que cada barra esté lado a lado (como lo hice), pruebe la siguiente variación:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
plt.style.use('seaborn-deep')

x = np.random.normal(1, 2, 5000)
y = np.random.normal(-1, 3, 2000)
bins = np.linspace(-10, 10, 30)

plt.hist([x, y], bins, label=['x', 'y'])
plt.legend(loc='upper right')
plt.show()

Referencia: http://matplotlib.org/examples/statistics/histogram_demo_multihist.html

EDITAR [2018/03/16]: Actualizado para permitir el trazado de matrices de diferentes tamaños, como sugiere @stochastic_zeitgeist

En el caso de que tenga diferentes tamaños de muestra, puede ser difícil comparar las distribuciones con un solo eje y. Por ejemplo:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

#makes the data
y1 = np.random.normal(-2, 2, 1000)
y2 = np.random.normal(2, 2, 5000)
colors = ['b','g']

#plots the histogram
fig, ax1 = plt.subplots()
ax1.hist([y1,y2],color=colors)
ax1.set_xlim(-10,10)
ax1.set_ylabel("Count")
plt.tight_layout()
plt.show()

En este caso, puede trazar sus dos conjuntos de datos en ejes diferentes. Para ello, puede obtener los datos de su histograma utilizando matplotlib, borrar el eje y luego volver a trazarlo en dos ejes separados (desplazando los bordes de la bandeja para que no se superpongan):

#sets up the axis and gets histogram data
fig, ax1 = plt.subplots()
ax2 = ax1.twinx()
ax1.hist([y1, y2], color=colors)
n, bins, patches = ax1.hist([y1,y2])
ax1.cla() #clear the axis

#plots the histogram data
width = (bins[1] - bins[0]) * 0.4
bins_shifted = bins + width
ax1.bar(bins[:-1], n[0], width, align='edge', color=colors[0])
ax2.bar(bins_shifted[:-1], n[1], width, align='edge', color=colors[1])

#finishes the plot
ax1.set_ylabel("Count", color=colors[0])
ax2.set_ylabel("Count", color=colors[1])
ax1.tick_params('y', colors=colors[0])
ax2.tick_params('y', colors=colors[1])
plt.tight_layout()
plt.show()

Aquí hay un método simple para trazar dos histogramas, con sus barras uno al lado del otro, en la misma gráfica cuando los datos tienen diferentes tamaños:

def plotHistogram(p, o):
    """
    p and o are iterables with the values you want to 
    plot the histogram of
    """
    plt.hist([p, o], color=['g','r'], alpha=0.8, bins=50)
    plt.show()

Suena como si quisieras solo un gráfico de barras:

• http://matplotlib.sourceforge.net/examples/pylab_examples/bar_stacked.html
• http://matplotlib.sourceforge.net/examples/pylab_examples/barchart_demo.html

Alternativamente, puede usar subtramas.

En caso de que tengas pandas (import pandas as pd) o estés de acuerdo con usarlo:

test = pd.DataFrame([[random.gauss(3,1) for _ in range(400)], 
                     [random.gauss(4,2) for _ in range(400)]])
plt.hist(test.values.T)
plt.show()

Debe usar los valores de retorno bins de hist:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

foo = np.random.normal(loc=1, size=100) # a normal distribution
bar = np.random.normal(loc=-1, size=10000) # a normal distribution

_, bins, _ = plt.hist(foo, bins=50, range=[-6, 6], normed=True)
_ = plt.hist(bar, bins=bins, alpha=0.5, normed=True)